La deuxième génération de 2008 adopte la plateforme PQ46 de la Volkswagen Passat B6 et introduit le célèbre mécanisme de coffre TwinDoor - une ouverture possible comme un hayon ou comme un coffre traditionnel. Cet ingénieux dispositif, allié à 565 litres de volume, lui permet de défier des berlines bien plus chères comme la Ford Mondeo.
Les motorisations couvrent un large spectre : 1.4 TSI 125 ch, 1.8 TSI 160 ch, 3.6 V6 FSI 260 ch en essence, et 1.9 TDI 105 ch, 2.0 TDI 140/170 ch en diesel. Le Combi, lancé simultanément, affiche 633 litres de coffre - un record absolu dans sa catégorie à sa sortie.
Le facelift de 2013 améliore l’insonorisation et modernise les équipements multimédia. Les problèmes recensés concernent principalement la boîte DSG 6 humide (à-coups et surchauffe en usage urbain intensif), la pompe à carburant haute pression des TSI de première génération, et le roulement de roue avant qui supporte mal les longues distances.