Restylée en 1998, la Xantia II apporte une face avant modernisée, un habitacle revu et surtout une gamme plus cohérente en fin de carrière. Elle reste l’alternative hydraulique à une Peugeot 406 classique : plus singulière, plus confortable, mais aussi nettement moins tolérante si l’entretien technique a été différé. Sur cette phase 2, la voiture paraît plus aboutie que la première, sans devenir plus simple.
La nouveauté majeure est l’arrivée du 2.0 HDi 109, qui donne enfin à la Xantia un diesel moderne en agrément, aux côtés des 1.8, 2.0 16V, 2.0 Turbo CT, 1.9 TD et 2.1 TD selon versions et marchés. Hydractive II, Activa, break, boîte auto sur certaines finitions : la phase 2 couvre large, mais impose toujours de juger le système hydraulique au même niveau que le moteur. Une belle Xantia II ne se choisit jamais sur le seul 2.0 HDi ou sur le seul niveau d’équipement.